回答：1、加工程度：農產品初加工的加工程度淺，加工時的層次少，農產品深加工的加工程度深，加工時的層次多。2、原料的理化特性：初加工的產品與原料相比，其理化性質和營養成分變化較小，深加工的產品與原料相比，原料的理化性質經過若干道加工工序發生了較大變化，同時營養成分也被分割開，進行了重新分配。
一、農產品初加工和深加工的區別
1、農產品初加工和深加工的區別
（1）加工程度
①農產品初加工的加工程度淺，加工時的層次少。
②農產品深加工的加工程度深，加工時的層次多。
（2）原料的理化特性
①初加工的產品與原料相比，其理化性質和營養成分變化較小。
②深加工的產品與原料相比，原料的理化性質經過若干道加工工序發生了較大變化，同時營養成分也被分割開，進行了重新分配。
2、農產品初加工和深加工的定義
（1）農產品初加工是指在不涉及農產品內在成分的改變的一次性的加工，包括對收穫的各種農產品進行的清理、分類、包裝等步驟的簡單的加工處理，以便於給初級市場提供服務。
（2）農產品的深加工是指對農產品進行二次以上的精細加工，包括對農產品的蛋白質資源、油脂資源、營養資源以及其它活性成分的提取和利用，使農產品發生了質的變化。
二、農產品初加工需要生產許可證嗎
1、農產品初加工需要辦理生產許可證。
2、辦理生產許可證的流程
（1）企業申請：填寫統一格式的申請表，同時提供企業相關證明等資料。有關部門受理企業的申請，對符合條件的企業發放受理通知書。
（2）現場審查：由政府有關部門負責組織企業生產條件審查和封樣，在受理申請後組織對生產條件進行審查並現場抽封樣品。
（3）樣品檢驗：申請取證的企業自行將樣品送達指定的檢驗機構，檢驗機構在規定的期限內完成檢驗工作。
（4）審定發證：審定符合發證條件的，由國家頒發生產許可證，不符合條件的，政府有關部門將上報材料退回並告知企業。
（5）後續處理：對不符合條件的企業發出不合格通知書，收回受理通知書，通知企業進行整改。
