適時收穫甘薯收穫過早，產量較低；收穫過晚，易遭受凍，影響貯藏。所以，一般最好在氣温18℃左右時開始收穫，氣温在10℃以上時(即枯霜期前)收穫完畢。一般先收切幹用的春瓜地，再收作種用的夏甘薯。
精選瓜塊在收穫選留好甘薯品種時，一定要精心刨割，避免外傷。為了多出苗、出壯苗和降低成本，應選塊根150―200克的瓜塊作種。所選的瓜塊要無病、無澇害，還要具有本品種的典型特性。收穫時，最好早晨割秧，上午收刨，下午入窖。
入窖貯藏用大屋窖或地窖貯藏，瓜種入窖前要對舊窖嚴格消毒，如用50%多菌靈600倍液或5%安索菌毒清水劑500倍液等噴灑瓜窖消毒。存放甘薯時，每存一層甘薯，就用“甘薯保險劑”稀釋液均勻噴灑一遍。現將大屋窖貯藏甘薯的特殊管理措施介紹如下：瓜種入窖前期(入窖15―20天)，應先加温18―24小時，使窖內温度達到35℃―38℃，保持四晝夜。以後打開天窗，排濕降温，經18―24小時，使窖温降至15℃；貯藏中期(入窖後20天到第二年春2月初)，主要是保温、升温，以防止瓜種受冷害，此時的窖温應穩定在12℃―13℃；貯藏後期(2月初到育苗)及時開窖檢查，排除多餘的二氧化碳。用以上方法儲藏的甘薯，保鮮時間長，甘薯完好率達96%以上。
