1、缺鐵或氮元素
檸檬樹在缺鐵或氮元素時會出現葉片發黃現象，而且缺哪種元素還比較好確認，如果缺鐵，一般葉片葉肉組織出現發黃現象；而如果缺氮，葉片的葉脈會發黃。所以通過仔細觀察能很好的分辨出缺乏鐵元素還是氮元素。
解決方法：通過辨認後，追施相對應的肥料即可，如果是幼苗期出現發黃現象，施肥時要注意濃度，以免肥料分解時散熱導致幼苗根系受損，施肥最好澆水，這樣可讓其快速吸收。
2、營養不良
和缺鐵、氮元素一樣，植株缺乏營養養分，在開花後應養分供應不上，導致葉片發黃並掉落。
解決方法：發生這種狀況，可先噴灑磷酸二氫鉀溶液，這種溶液不僅富含氮、磷、鉀常規元素，還含有其他微量元素，能很好的提供檸檬樹生長所需。
3、根系腐爛
澆水不當、長期陰雨天氣導致土壤的積水過多，易造成土壤板結、通透性較差，檸檬樹根系呼吸困難，生長受到阻礙，這些原因很容易導致它的根系腐爛，然後葉片開始發黃，嚴重者檸檬樹會死亡。
解決方法：先將根系土壤挖開一部分，查看是否是真的爛根，爛根的情況怎麼樣。如果是小範圍的爛根，可將樹體的腐爛根系切除掉，並塗抹藥劑防治病菌侵入，等傷口復原後，即可重新栽植，重新栽植後切記不宜多澆水和施肥濃度較高。
4、病蟲害
很多種病蟲害都會導致檸檬樹葉片發黃現象，如瘡痂病、潰瘍病，它們發病時葉片出現黃色的小斑點，蟲害也是如此，導致葉片發黃。
解決方法：平時要加強管理，噴灑相對應的藥劑進行防治。
