施肥是維持土壤肥力，滿足果樹生長髮育所需營養元素的重要措施。番石榴一年多次開花結果，掛果期長、產量高，養分消耗大，因此，要注意加強施肥管理，以維持生長勢，改善地力。研究表明，每生產100千克番石榴鮮果所帶走的養分為：氮1.83千克、磷0.39千克、鉀1.62千克、鈣0.90千克、鎂0.22千克、鈉0.24千克。其氮磷鉀鈣鎂比為1:0.21:0.89:0.49:0.12。番石榴養分需要量與品種、產量、修剪程度等因素有關。番石榴產量越高，修剪程度越重，所需的養分量越多。
1、幼齡樹施肥幼齡樹施肥以促進生長、迅速形成豐產樹冠為目的。定植施用基肥，以堆肥、廄肥、人畜糞尿和餅麩肥為主。每株施用10~15千克，配施少量磷、鉀、鈣肥，可施過磷酸鈣或鈣鎂磷肥1千克。除施基肥外，配合修剪和培養枝梢的次數施肥，掌握培養一次枝梢施肥一次的原則，以農家肥主為，配施少量速效氮肥。幼齡番石榴每年至少施兩次主肥，第一次在8~9月施，可每株施腐熟廄肥20~30千克、複合肥0.5千克，第二次在翌年4~5月施，施複合肥1.5~2.0千克，配以葉面施肥。
2、結果樹施肥由於番石榴全年均可開花、結果，故結果樹施肥應依培育幾次花果為重點來決定，圍繞促發健壯枝梢，促進開花結果，改良土壤，促進根系發過為目的來進行。目前對番石榴營養特性及營養需求研究不多，各地對番石榴的施肥在很大程度上還是根據生產經驗。
廣西番石榴產區主要根據其生長結果特點來施肥，一般在2~3月新梢萌動期施促梢肥，3~4月現蕾期施促花肥，5月果實膨大期施壯果肥，7月正值頭造果採前迅速增大，需再施壯果肥及促二造果果枝萌發肥，9~10月施二造果壯果肥及促三造果果枝萌發肥，11~12月施三造果壯果肥，翌年1~2月採果後至萌芽前施過冬重肥。
廣州地區對中、遲熟品種主要培育正造果，故施肥主要是春梢萌芽前、果實發育期及採果後各施肥1次，對有翻花果的早熟品種，在正造果及翻花果採收後各施1次。在台灣，番石榴多進行產期調節栽培，減少夏、秋果，增加冬、春果，一般於2、5、7、8及11月各施肥1次，8月及11月的施肥對冬春果發育、提高品質有重要作用，是產期調節不可缺少的。有機肥可於2月施下，作為基肥以便緩慢分解利用。在印度，氮、鉀肥一般在2月、5月上旬、7月上旬和8月分4次施下。
番石榴施肥量及N、P、K適宜比例各地相差較大。台灣在番石榴種植後10年內，隨着樹齡的增加，施用量也逐年增加。5齡前N、P、K比例為1:1:1，逐漸過渡到（10年後）2:1:2的比例。柯立樣等推薦泰國番石榴的年株施肥量為氮肥0.2千克、五氧化二磷0.1千克、氧化鉀0.4千克，N、P、K比例為2:1:4。印度番石榴高產園的年株施肥量為氮0.583千克、磷0.271千克、鉀0.399千克，氮磷鉀三要素比例為1:0.46:0.68。南非成年番石榴年株施用量為氮0.224千克、磷0.045千克、鉀0.20千克，三要素施用比例為1:0.20:0.89。
肥料施用時，可於樹冠的垂直位置挖一淺溝，溝長0.7~0.8米，寬0.2~0.3米，深0.1米，將肥料施入溝內，混合後覆土。另外，磷肥可在離樹幹1.0~1.6米處挖長0.6米的環溝施下，可提高肥料利用率。旱季施肥若與灌溉配合，肥效更佳。此外，根外追肥對番石榴也有較好的效果。葉片施鋅保果作用顯著，還可提高果實中可溶性固形物，改善品質；施用硝酸鈣能增加營養生長的速度，顯著縮短花芽發育期，並提早開花，提高着果率。生產上在始花期和幼果期噴施0.6%硫酸鋅、0.2%硼酸和0.05%鉬酸銨，對增進夏、冬果的品質有良好的效果。台灣於9、10月每隔5天噴1次，連續3次噴0.4%~0.6%磷酸二氫鉀，可提高冬春果的品質。噴葉面肥時，在嫩梢展葉期濃度低些，葉片老熟後濃度可高些。
