冬季對石榴樹進行整形修剪，在落葉後至萌芽前進行。重點清除根櫱和剪除徒長枝、過密枝、細弱枝、病蟲枝、下垂枝、交叉枝、重疊枝等。石榴樹要根據不同年齡、不同樹勢進行合理修剪，修剪時注意以下要點：
定植後第一年，枝葉全部保留，養樹養根，促使生長。
第二年選定樹形留好骨幹枝，對主幹上的纖細枝和地面上的萌孽全部清除，注意儘量保留樹上的枝條，一般不能採用短截，確實過密的枝條可疏除。
對於初果樹要注意培養側枝和結果枝組，以輕剪、疏枝為主；去強枝、留中庸偏弱枝，去直立枝，留水平斜生枝；去病蟲枝，留健壯枝；多疏少截或不截，變向緩剪等，使樹冠中庸而達到開好花，結好果的目的。
對於盛果期樹要保持樹冠原有結構，維持樹勢中庸健壯，對於外圍上部過多的強旺枝要促其生長緩和，過多的側枝要酌情疏除或縮剪，近於直立的骨幹枝要注意加大生長角度，為維持樹體長勢可以輪換更新復壯枝組。
對石榴樹進行冬季修剪時，要將病蟲枝全部疏去或剪掉，以減少或消滅再侵染的病蟲源。
修剪時造成的傷口，要及時封閉防止乾裂、污染。通過塗抹愈傷防腐膜，使樹體形成一層保護膜；向內使樹體中的病原菌窒息死亡，向外阻止了病蟲害的侵入；保護傷口癒合組織生長，使樹勢得到很好的恢復。
