芒果單胚品種的一個種子只萌生一株苗，多胚品種能萌發長成多株苗。單胚種子只有一個胚（有性胚），胚大，發育成的單一苗強壯；多胚種子有多個胚，胚較小，發育成的多株苗較弱。故過去強調採用單胚品種作砧木。但砧木的一致性對提高芒果產量和品質是很重要的，單胚苗是有性苗，生長表現差異很大，果園內不同植株生長和產量的巨大差異很可能因砧木而引起。因此，應經過試驗後選用多胚品種的種子培育砧木苗。過去多推薦用果較小、果肉少、品質較差但胚充實飽滿的土芒作砧木，這些土芒多為單胚，生長強壯，由於上述原因作砧木並不理想。至於適合作砧木的多胚品種尚需通過嫁接親和力、適應性和優質豐產性等試驗來確定。
實生苗主要用作砧木或育種試驗。培育實生苗所用的種子應來自同一品種，採自成熟的果實，種子要飽滿、無病、無蟲。要儘可能快地取出播種，因為芒果種胚對失水敏感，一經乾燥，發芽力迅速降低。種子要剝去纖維質的皮和膜質層，用０．１％高錳酸鉀液浸１分鐘，取出晾乾即可播種。播種基質最好用中粗河沙或蛭石，沙牀厚度３０釐米。
如果是已用過的苗牀，則要用１％福爾馬林水溶液噴灑透，用塑料薄膜覆蓋２４小時殺菌，再晾２４小時散盡氣味。種胚也可在暗處保濕使胚芽萌動後再播下。播時種胚平放，單胚則使胚芽朝同一個方向，緊密排列，行距１５釐米。播後覆蓋一層２釐米厚的河沙或蛭石。如不蓋塑膜保濕，氣温高、空氣濕度低時，必須每日淋水。如蓋膜遮蔭保濕，可３－５天淋水一次，以不幹燥為度。在廣州，６－１０月間播種，１５－２０天小苗便可出土，一般在具３－５片紅葉時移栽於育苗地。多胚種子每個可分出３－４株苗，大小苗應稍加分級，並剔除弱苗。單胚種子苗移植時間可稍遲。
為培育優質苗木，最好採用長度３０－４０釐米以上、裝土３公斤以上的育苗袋培育砧木苗供嫁接。因為芒果鬚根少，袋裝育苗有利於移栽成活。在苗圃地育苗的，要選較粘質土，以便起苗時容易帶上泥團。在移栽時須剪去部分主根，留下１０釐米左右，或把主根盤繞起來，以促側根發生。育苗袋的土質可稍砂，但因施肥不如地裏方便，故應混入足量的腐熟有機肥，以保證根系良好發育。移苗後要繼續遮蔭至葉片完全轉錄，枝條老熟後再給予全光照。單胚種子也可直接播於育苗袋內。
