對於辣椒枯萎病通常可以在發病初期，用14%絡氨銅水劑300倍液或者40%多硫懸浮劑600倍液進行灌根，每株灌藥250g，或者噴灑50%多菌靈可濕性粉劑500倍液進行防治。為了降低該病發生概率應選擇抗病性強的辣椒品種，例如黃龍線椒，並將它種在排水良好的壤土中，避免選擇地勢低窪的地塊，雨後及時清溝排水，乾旱後科學的進行灌水，不能夠連續灌水和大水漫灌，以此來降低田間的濕度，因為濕度過大利於該病的發生。
一、辣椒枯萎病特效藥
1、藥物種類
（1）一般可以在發病初期，用14%絡氨銅水劑300倍液、40%多硫懸浮劑600倍液等藥劑進行灌根，每株灌藥250g，而灌藥的次數則應根據病害的嚴重程度合理的連灌2-3次。
（2）也可以在發病初期，噴灑50%多菌靈可濕性粉劑500倍液進行防治。
2、防治方法
（1）需要根據各地的情況選擇抗病性強的辣椒品種，例如黃龍線椒、澄城線椒、西農20號線椒等品種。
（2）而在栽種時應挑選排水良好的壤土，不宜挑選地勢低窪的地塊，若遇到下雨，還應在雨後及時進行清溝排水，以此來降低田間的濕度。
（3）當出現乾旱時應該科學的進行灌水，不可以連續灌水，或者進行大水漫灌，若發現病株還需要及時拔除，並集中燒燬，避免病情進一步擴大。
二、辣椒枯萎病是什麼原因引起的
1、原因
（1）該病多在土壤潮濕、土壤黏重、連作且排水不良的地塊中發生，同時偏施氮肥也利於該病的發生。
（2）當根結線蟲危害嚴重時，會加劇該病的發生，而在高温高濕的環境下，發病的程度通常比較嚴重。
2、症狀
（1）該病多在幼苗期、開花坐果期發生，主要會危害植株的根部或者根頸處。
（2）在發病初期，病菌會影響根莖對水分的吸收，導致辣椒在白天會出現與缺水相似的萎蔫，但是在晚上又可以恢復。
（3）當苗期萎蔫現象持續出現2-3天后，辣椒下部的葉片就會變黃，或者直接脱落，直到整株辣椒苗萎蔫死亡。
