草魚是淡水魚類，呈圓筒形，無須，是典型的草食性魚類，草魚生活在河流、湖泊等水域中、下層和近岸的多水草區域，草魚適應能力強。鯉魚屬淡水魚類，鯉魚身體側平腹圓，須2對，鯉魚屬於底棲雜食性魚類，是底棲魚類，多生活在平靜、水草叢生的泥底的池塘、湖泊、河流中，是無胃魚種，腸道短，新陳代謝速度快。
一、科屬區別
1、草魚：草魚是動物界、脊索動物門、脊椎動物亞門、輻鰭魚綱、新鰭亞綱、鯉魚目、鯉亞目、鯉科、雅羅魚亞科、草魚屬於淡水魚類。
2、鯉魚：鯉魚是動物界、脊索動物門、脊椎動物亞門、硬骨魚綱、輻鰭亞綱、鯉形目、鯉亞目、鯉科、鯉魚屬淡水魚類。
二、形態差異
1、草魚：草魚呈圓筒形，頭部稍平，尾部側平，口弧形，無須，上頜略長於下頜，吻非常短，體淺茶黃色，背部青灰，腹部灰白，胸、腹鰭有點灰黃，其他各鰭淺灰色，體長，腹部無稜，頭部平扁，背鰭和臀鰭均無硬刺，背鰭和腹鰭相對。
2、鯉魚：鯉魚身體側平腹圓，口呈馬蹄形，須2對，鱗有十字紋，死後鱗不反白，有從頭到尾的脅鱗一道，不論魚的大小都有36鱗，每鱗上都有黑點，背鰭基部長，背鰭和臀鰭都有一根粗帶鋸齒的硬棘，身體側金黃色，尾鰭下葉橙紅色。
三、食性差異
1、草魚：草魚是典型的草食性魚類，魚苗階段攝食浮游動物，幼魚期兼食昆蟲、蚯蚓、藻類和浮萍等，體長約10釐米以上時完全攝食水生高等植物，其中禾本科植物多。
2、鯉魚：鯉魚屬於底棲雜食性魚類，肉菜兼食，食譜廣泛，如軟體動物、高等水生植物碎片、底棲動物、細藻類或人工合成餌料都吃，自然條件下食物偏向動物性食物。
四、習性區別
1、草魚：草魚生活在河流、湖泊等水域中、下層和近岸的多水草區域，具有河流和湖泊的洄游習慣性，性成熟的個體在河流、水庫等流水中產卵，產卵後的親魚和幼魚進入支流和通過河流和湖泊，通常在被水淹沒的淺灘草域和泛水區域及干支附屬水體（湖、小河、港道等水草叢生地帶）攝食育肥。
2、鯉魚：鯉魚是底棲魚類，多單獨或小羣生活在平靜、水草叢生的泥底的池塘、湖泊、河流中，鯉魚的活動區域不變。季節的變化、水温的冷温、風向、氣壓的高低、朔望更替、水質的清濁、水流的大小、水位的漲落、水體溶氧環境等都會隨時改變其活動區域。
五、覓食區別
1、草魚：草魚適應能力強，可在0~38℃的温度範圍內生存，但要求水質清瘦，食慾與水温和水質有關，水温在25~30℃時攝食量最大，日攝食量達到體重的40%，水温在20度以下時攝食量明顯下降，水温在5度以下時停止攝食。
2、鯉魚：鯉魚是低等變温動物，不需要消耗能量來維持恆定體温，攝食總量不大，同時因屬於無胃魚種，腸道短，新陳代謝速度快，所以少吃勤食，鯉魚的消化功能與水温有很大關係，20℃左右食慾最旺盛，水温低於10℃活動量大大下降，水温低於2℃時基本不覓食。
