灰黴病多數在春季發病，會進入高峯期。因此在春季，種植户應加強管理，注意觀察，如果發現病情時及時摘除病葉和病葉，並用藥治療，如噴施黴止加大蒜油，兑水進行噴霧，隔3至4天噴一次，連噴2至3次。
預防為主，治療為輔。應當預防為主，或者在發病初期就及時打藥。市面上，防治常用的藥劑：異菌脲.腐黴利，啶酰菌胺，咯菌腈，嘧菌環胺，啶菌噁唑，等藥加磷酸二氫鉀噴霧處理。注意交替不同的成分是使用，不要連續是使用同一殺菌劑。
在配好的蘸花葯液里加入0.2%～0.3%的50%多·黴威可濕性粉劑，或50%福·異菌可濕性粉劑，或65%甲硫·黴威可濕性粉劑後進行蘸花或噴花。在花期和果實膨大期每667米2用65%甲硫·黴威可濕性粉劑21千克噴粉防治，7～10天1次，共3～4次。也可採用一些生物農藥，如木黴菌可濕性粉劑600～800倍液、2%武夷菌素水劑150倍液等。
加強栽培管理，實行輪作，栽種前進行土壤消毒，同時用65%代森鋅可濕性粉劑300～400倍液將種苗浸泡10～12分鐘然後再栽種。栽植時不宜過密，生長期間不要偏施氮肥。
番茄的灰黴病，建議清除殘花，摘除病體，合理摘葉透風，降低濕度，噴施丁子香粉，腐黴利，嘧黴胺，異菌脲，凱澤，乙黴威等藥劑治療。
