加強栽培管理，實行輪作，栽種前進行土壤消毒，同時用65%代森鋅可濕性粉劑300～400倍液將種苗浸泡10～12分鐘然後再栽種。栽植時不宜過密，生長期間不要偏施氮肥。
發病初期及時摘除病葉、枝、芽和帶病的花蕾，然後噴灑50%代森銨800～1000倍液。噴藥重點除患部外，還有土壤表面。每隔15天左右噴一次，連續噴2～3次，即能取得良好防治效果。
藥劑防治:在配好的蘸花葯液里加入0.2%～0.3%的50%多·黴威可濕性粉劑，或50%福·異菌可濕性粉劑，或65%甲硫·黴威可濕性粉劑後進行蘸花或噴花。在花期和果實膨大期每667米2用65%甲硫·黴威可濕性粉劑21千克噴粉防治，7～10天1次，共3～4次。也可採用一些生物農藥，如木黴菌可濕性粉劑600～800倍液、2%武夷菌素水劑150倍液等。
藥劑防治。發病初期及時摘除病葉、枝、芽和帶病的花蕾，然後噴灑50%代森銨800～1000倍液。噴藥重點除患部外，還有土壤表面。
番茄灰葉斑病只為害葉片，發病初期葉面佈滿暗色圓形或不正圓形小斑點，後沿葉脈向四周擴大，到後期會破裂，穿孔甚至脱落。可用10%苯醚甲環唑水分散粒劑1500倍液+70%甲基託布津可濕性粉劑600倍液、25%嘧菌酯懸浮劑1500-2000倍液、25%阿米西達懸浮劑1500倍液、10%苯咪甲環唑1500倍液、64%殺毒礬400倍液、52%抑快淨水劑1800倍液、75％達科寧可濕性粉劑600倍液、80％大生可濕性粉劑600倍液噴霧防治，每隔7～10天噴1次，連續2～3次。
灰黴病，持續低温、陰天、高濕、光照不足、通風不及時等均會引起灰黴病的發生，保持棚內温度和光照，適當降低田間濕度，可以在點花葯中添加腐黴利等藥劑進行預防，發生初期及時摘除病葉、病果並用藥，可選用啶酰菌胺、腐黴利、異菌脲、啶菌噁唑、氟菌·肟菌酯等藥劑進行防治，注意藥劑的調換使用，以免產生抗性。
灰黴病：預防：施佳樂600倍或撲海因800倍，使用安全，預防效果佳。治療：露娜森1500倍+鋭效嘉1500倍，目前防治灰黴最有效的藥劑，持效時間達20天以上。注意：在番茄沾花葯劑中加入撲海因，每斤水加入撲海因2ml，能起到預防灰黴病侵染果實的目的。
藥劑防治。發病初期及時摘除病葉、枝、芽和帶病的花蕾，然後噴灑50%代森銨800～1000倍液。噴藥重點除患部外，還有土壤表面。每隔15天左右噴一次，連續噴2～3次。
棚室栽培在發病初期，噴撒5％加瑞農粉塵劑，或7％防黴靈粉塵劑，或5％滅黴靈粉塵劑，用量為每667平方米每次1千克；也可以每667平方米用15%克菌靈煙黴劑（速克靈十百菌清）200克薰治。
番茄灰黴病，用75%百菌清800倍液，50%多菌靈500倍液，75%甲基託布津800倍液，45%特克多（噻菌靈）懸浮劑3000倍液，60%防黴寶超微粉劑500倍液，2%武夷菌素（BO－10）水劑150倍液，以上藥劑交替使用，每5天1次，連續噴灑2—3次。
