病株率5%～40%。芝麻植株染病後，初在莖稈上出現暗綠色斑塊，後變為黑褐色條斑，頂梢上常有2～3個梭形潰瘍狀裂縫，起初檀株頂端萎蔫，後下部葉片萎凋，呈失水狀，發病輕時夜間尚可恢復，幾天後不再復原，剖開根莖可見維管束變成褐色，不久蔓延至髓部，出現空洞，濕度大時有菌膿溢出，逐漸形成漆黑色晶亮的顆粒，病根變成褐色，細根腐爛。病株的葉脈出現墨綠色條斑，縱橫交叉呈網狀，對光觀察呈透明油浸狀，葉背的脈紋呈黃色波浪形扭曲突起，後病葉褶皺或變褐枯死。蒴果初呈水浸狀病斑，後也變為深褐色條斑，蒴果瘦癟，種子小不能發芽。
芝麻青枯病能夠危害芝麻整個植株，從根部、葉片到蒴果都會受到青枯病的危害。莖部：危害初期，芝麻植株莖部會出現綠色的病斑，隨着病害的家種，後期會變成黑色的條狀病斑，莖內外有菌膠溢出，後變成黑色的顆粒。葉片：危害初期，明顯可見葉脈上有墨綠色的條斑，縱橫交錯分佈，並且在中心位置呈油漬狀。隨着病害的加重，葉片萎蔫程度會明顯增加，後期植株會慢慢枯萎而死。蒴果：危害初期，蒴果會出現水漬狀的病斑，顏色變成深褐色，隨着病害的加重，病斑變成條斑，導致蒴果瘦小，籽粒不飽滿，影響品質和產量。
芝麻植株染病後，初在莖稈上出現暗綠色斑塊，後變為黑褐色條斑，頂梢上常有2～3個梭形潰瘍狀裂縫，起初檀株頂端萎蔫，後下部葉片萎凋，呈失水狀，發病輕時夜間尚可恢復，幾天後不再復原，剖開根莖可見維管束變成褐色，不久蔓延至髓部，出現空洞，濕度大時有菌膿溢出，逐漸形成漆黑色晶亮的顆粒，病根變成褐色，細根腐爛。病株的葉脈出現墨綠色條斑，縱橫交叉呈網狀，對光觀察呈透明油浸狀，葉背的脈紋呈黃色波浪形扭曲突起，後病葉褶皺或變褐枯死。蒴果初呈水浸狀病斑，後也變為深褐色條斑，蒴果瘦癟，種子小不能發芽。
