要選擇生長結實、無病蟲害的檸檬株作為採種母樹，採摘檸檬果，放置幾天後切開果實，取出種子洗淨，立即播種或保存在果實中，春天取出種子播種，可以使用扦插繁殖，壓條繁殖和嫁接繁殖。春天多采用切接，腹接一般用於秋季嫁接，芽接分為小芽切接和小芽腹接兩種。切斷滅菌的莖尖，保持極性接種到愈傷組織的誘導培養基礎。
一、檸檬樹種子繁殖
選擇生長結實、無病蟲害的檸檬株作為採種母樹，11-12月果實充分成熟時採摘檸檬果，放置幾天後切開果實，取出種子洗淨，立即播種或保存在果實中，春天取出種子播種，乾燥的種子不能長時間隱藏，容易失去發芽力，鮮種子在15-25℃變温條件下，只用7天就可以發芽。
二、檸檬樹扦插繁殖
檸檬扦插容易生存，5月下旬修剪的當時的健壯春梢，留下3-4芽剪穗，除了留下頂芽的葉子外，其餘的扦插在砂土中，扦插後立即澆水，之後每隔幾天澆水一次，扦插後葉子保持青綠不枯萎，一個月後頂芽開始生長，每隔20天追加一次糞水，當時夏梢和秋梢檸檬樹的壓條繁殖。
三、檸檬壓條繁殖
主要採用高壓繁殖，5-6月生長旺盛，選擇無病蟲危害的枝條作為繁殖母枝，在高壓部分，切除葉片，用刀環剝離4-6釐米，剝離皮層，但不能傷害木質部分，然後使用長約12釐米、寬約10釐米的塑料薄膜，剝離皮下部的2釐米高壓後葉片呈淡綠色，塑料袋長出白嫩的根，逐漸充滿周圍，説明高壓成功，9-10月在塑料袋下部剪枝，輕輕拆除塑料薄膜，注意不要破泥，種在花盆裏，澆水，放在陰涼處緩苗，10-15天，慢慢增加光照，就可以長出新葉。
四、檸檬樹的組織培養
切斷滅菌的莖尖，長5-8毫米，保持極性接種到愈傷組織的誘導培養基礎。經過3-4周的培養，外植體開始形成愈傷組織。這個時候就可以把它切下來，然後轉到芽誘基上。再過幾周的培養，可以形成芽叢，切成根誘導培養。經過3-4周的培育，可以形成帶根系的再生株。培養温度為24-26℃，每天光照8-12小時，光照1000-2000勒克斯。
五、檸檬樹嫁接繁殖
1、切接：春天多采用切接。樹液開始流動時嫁接效果好，四川、重慶地區可在雨水節前後半個月嫁接，廣東立春後40天嫁接成活率高。在氣温較低的份，嫁接時間可以延遲到5月。切接操作簡單，發芽快，生長快，當時可達到發育規格，秋季或次年春季可定植。
2、腹接：腹接一般用於秋季嫁接，雨水節後至11月上旬可進行。腹部連接成活率高，一次沒有連接，可以連接2-3次，接穗切割法與切割法相同，離地約10釐米，選擇光滑面從上向下縱切，長2釐米左右，切割深度最好傷害或傷害木質部。開口後，立即嵌入接穗，用塑料薄膜條從下往上捆緊密封接口。
3、芽接：芽接分為小芽切接和小芽腹接兩種，小芽切接主要在春天進行，小芽腹接主要在秋天進行。芽接速度快，工作效率高，砧木傷口小，容易癒合。削芽時，左手倒拿接穗，右手握刀，刀口平整，從芽的下端1釐米向芽的上端削到芽的上端0.5釐米為止，將芽帶到木質部，用刀垂直向下切刀，取下芽。
