蒼蠅的天敵可分為捕食性天敵、寄生性天敵以及微生物天敵。
捕食性天敵：主要包括鳥類、蜥蜴、壁虎、青蛙、蜻蜓、蜘蛛、螳螂、螞蟻、食蟲虻等生物。
寄生性天敵：主要包括姬蜂、小蜂等寄生蜂類。
微生物天敵：主要為森田芽孢桿菌，其可以抑制蒼蠅孳生。
一、蒼蠅的天敵
1、捕食性天敵
包含青蛙、蜻蜓、蜘蛛、螳螂、螞蟻、蜥蜴、壁虎、食蟲虻和鳥類等，雞糞是家蠅和廄蠅的孳生物，但其中常存在生性兇殘的巨螯蟎和蠼螋，會捕食糞類中的蠅卵和蠅蛆。
2、寄生天敵
如姬蜂、小蜂等寄生蜂類，它們往往將卵產在蠅蛆或蛹體內，孵出幼蟲後便取食蠅蛆和蠅蛹。有人發現，在春季挖出的麻蠅蛹體中，60.4%被寄生蜂侵害而夭亡。
3、微生物天敵
日本學者發現森田芽孢桿菌可以抑制蒼蠅孳生。
二、蒼蠅怕什麼植物
有的植物具有特殊的香氣或氣味，對人無害，而蚊子、蟑螂、蒼蠅等害蟲聞到就會避而遠之。這些特殊的香氣或氣味，有的還可以抑制或殺滅細菌和病毒。這些植物包括：晚香玉、除蟲菊、野菊花、紫茉莉、檸檬、紫薇、茉莉、蘭花、丁香、蒼朮、玉米花、蒲公英、薄荷等。
1、夜來香：又名夜香樹，原產美洲熱帶。葉片心型，邊緣披有柔毛，每逢夏秋之間，在葉腋就會綻開一簇簇黃綠色的吊鐘形小花，當月上樹梢時，它會飄出陣陣清香，這種香味令蚊子害怕，是驅蚊佳品。
2、薰衣草：一種藍紫色小花，原產地為地中海，花型像小麥穗，一般在六月開花。薰衣草本身具有殺蟲效果，人們才將它做成香包放在衣櫥中，也有放在卧室的，用於驅蚊。
3、豬籠草：食蟲植物，捕蚊高手。
4、七里香：七里香為四季常綠的小灌木，外形成傘房狀，葉小亮澤，花白繁密，結紅色果實，摸其葉片會感到濃濃的甜香，驅蚊效果非常好。
5、食蟲草：菊科草本植物，花小黃色，一株植物可有數百隻花頭，各花頭的外圍有粘液，只要有小蚊蟲落在上面便被粘住了，蟲子的屍體會慢慢的消化作為其生長營養，若是有灰塵落在上面，數天後也被消化的無影無蹤，家中擺上一盆食蟲草捉蟲又吸塵。
6、逐蠅梅：枝葉和花散發出蚊蠅敏感的氣味，具有很強的驅蚊功效，對人體無任何傷害。
三、蒼蠅怕什麼氣味
蒼蠅比較害怕部分植物所散發出的特殊氣味、燃燒的橘子皮味、生薑和大蒜味、白醋味以及燃燒的艾葉草的味道。晚香玉，除蟲菊，野菊花，紫茉莉，檸檬，茉莉，蘭花，蒲公英以及薄荷等植物的味道蒼蠅聞到後便會自動的遠離。
