大豆紫斑病的發生和流行與菌源量的多少及温度的高低關係很大。種子帶菌率高，子葉被害重；感病子葉又為田間發病提供侵染來源。病菌可在帶病植株殘體上越冬，故大豆連作的田內菌源多病害也重。該菌要求的温度較高，結莢期温度25.5-27℃，再有多雨，大豆紫斑病發生重。
病菌以菌絲體潛伏在種皮內或以菌絲體和分生孢子在病殘體上越冬，成為翌年的初侵染源。如播種帶菌種子，引起子葉發病，病苗或葉片上產生的分生孢子借風雨傳播進行初侵染和再侵染。大豆開花期和結莢期多雨，氣温偏高，均温25．5～27℃，發病重；高於或低於這個温度範圍發病輕或不發病。連作地及早熟種發病重。
