小麥種子、幼芽、幼苗、成株根系、葉片、莖和穗都可受害，出現症狀複雜多樣。幼芽和幼苗的種子根變褐色，幼芽腐爛不能出土。出土幼苗近地面葉上散生圓形褐色病斑，嚴重時病葉變黃枯死。芽鞘上生褐色條斑。成株根上的毛根和主根表皮脱落，根冠變褐色。莖基部出現褐色條斑，嚴重時莖折斷枯死。葉上初生許多黑色小點，後擴大呈梭形，中部枯黃色，周圍有退綠暈圈。病斑兩面出現黑色黴層，即病原菌的分生孢子梗和分生孢子。葉上病斑相連時，葉片枯死。穗部的穎殼基部變褐色，表面密生黑色黴層，穗軸和小穗軸常變褐色腐爛，小穗不實或種子不飽滿。種子胚局部或全部變褐色形成“黑胚粒”。種子表面也生梭形或不規則形褐斑。
防治方法：①農業措施：根腐病嚴重地區與豆類作物、油菜、蔬菜等非禾本科作物輪作。②藥劑防治：用20%三唑酮乳油50ml或12.5%全蝕淨水懸浮劑100-150mg兑水2kg，拌麥種50kg，用種子重量0.2％～0.3％的50％代森錳鋅可濕性粉劑，或50％福美雙可濕性粉劑等藥劑拌種。成株發病初期噴灑藥劑防治。
