水稻是吸硅量最多的作物之一，莖葉中的含硅量可達10％~20％。每生產100千克稻穀稻株要吸收硅酸17~18千克。根部所吸收的硅隨蒸騰上移，水分從葉面蒸發，大部分硅酸積累於表皮細胞的角質內，形成角質硅酸層。因硅酸不易透水，所以有降低蒸騰強度的作用。充分吸收硅的水稻葉片伸出角度小，葉成直立，受光姿態好，可增強光合作用的能力。硅酸的存在還能增強根部的氧化力，能使可溶性的二價鐵或錳在根表面氧化沉積，不至於因過量吸收而中毒。同時，促進根系生長，改善根的呼吸作用，促進對其他養分的吸收。施用硅肥，水稻同化作用旺盛，幹物質積累量大，從而稀釋植物體內氮的濃度，表現為增強耐氮性。施硅酸肥料還可促使磷向穗部轉移。
缺硅的水稻體內可溶性氮和糖類增加，容易誘致菌類寄生而減弱抗病能力。已有研究認為，莖葉中的硅酸化合物能對病原菌呈現某種毒性而減少危害。水稻生殖生長長期如不能滿足硅酸的的供應，則易降低每穗粒數和結實率，嚴重時變成白穗。
