俗語説“苗好五成收”，育成健壯無病蟲害的苗子是栽培成功的一半。西紅柿在兩葉一心至5片葉時是1-3穗果的花芽分化期，苗期決定一茬大棚西紅柿的產量和質量。
1、選擇保温性能好的小温室，保證夜温不低於15度，播種前15-20天蓋好棚膜烤棚。播種前5-7天裝好營養缽。營養土的土、肥比為3：1，肥料要選用腐熟的有機肥，最好是生物有機肥或2個億活菌的菌肥。
2、關鍵措施。⑴營養土的消毒。按牀土的0.01%加入菌毒淨和菌蟲速滅，即1000公斤牀土加入100克菌毒淨和100克菌蟲速滅混拌均勻進行營養土消毒。⑵裝缽。裝缽時要注意上松下實，並在上面留2釐米的空間，以便以後澆水。選營養缽時，不要選有毒的再生膜制的營養缽。
3、催芽播種。大棚西紅柿一般在7月下旬到9月上旬播種。關鍵措施是：⑴浸種催芽。用55℃的温水浸種，隨倒水隨攪拌，並保持水温55℃5-10分鐘，10分鐘後緩慢加涼水待水温冷卻至35℃時停止攪拌，保持30℃左右水温浸種2個小時以上，最長不超過6個小時。將種子搓洗乾淨置於25-30℃的温度條件下催芽，經過24小時有一半種子露白時就可進行播種。⑵播種。將2-3粒發芽的種子播到營養缽的中央，而後覆土1.5釐米厚。播種完畢後，將缽面噴一遍500倍菌毒淨進行殺菌。
4、出苗前的管理。重點是提高温室温度，促其儘快出苗。適當晚揭早蓋。
5、出苗後的管理。當幼苗有80%出土後，應立即將畦面上的薄膜揭掉。出真葉前應適當降低温度5-7天，此時白天保持20-25℃，夜間12-15℃，且苗牀不要過濕，防止發生猝倒病。第二片真葉出現後，每缽保留一株壯苗，將餘苗剪掉，此時要適當提高温度，促進幼苗生長，白天22-28℃，夜間14-18℃，並給予充足的光照。從出現第一片真葉到四葉一心，要隔7-10天噴一次菌毒淨800倍液、生物肥精800-1000倍液，以防猝倒病、立枯病等。
