除草用的農藥主要有50%撲草淨、利谷隆、44%單嘧·撲滅等，而病蟲害防治時使用的農藥有粉鏽寧可濕性粉劑、噻菌銅懸浮劑、代森錳鋅及氯氰菊酯乳油、呋喃丹、可美雙可濕性粉等。蟲害不同，防治措施也不同，主要還是採用農業措施防治，但也可採用農藥，一般用的農藥有氯氰菊酯乳油、呋喃丹、可美雙可濕性粉等。
一、穀子除草農藥
1、穀子在生長過程中一般只有在需要除草及防治病蟲害時需要使用農藥，除草用的農藥主要有50%撲草淨、利谷隆、44%單嘧·撲滅等，而病蟲害防治時使用的農藥有粉鏽寧可濕性粉劑、噻菌銅懸浮劑、代森錳鋅及氯氰菊酯乳油、呋喃丹、可美雙可濕性粉等。
2、撲草淨主要是針對馬唐、狗尾草、稗等禾本科雜草及藜、莧、鴨舌草、眼子草等多種闊葉雜草。使用方法是50g/畝兑水40-50kg噴霧地表。利谷隆主要是防除部分一年的生禾本科及多種闊葉雜草，使用方法是400-500g/畝兑水40-50kg水噴霧。44%單嘧·撲滅針對的是闊葉雜草及單子葉雜草，使用方法是52.8~70.4g/畝兑水40-50kg水噴霧。
二、穀子的病蟲害防治農藥
1、穀子的主要病害有穀子白髮病、穀子鏽病、谷瘟病、穀子葉斑病及穀子褐條病等。
（1）穀子白髮病稱刺蝟頭，用50%多菌靈可濕性粉劑600-800倍液在抽穗前及揚花後噴霧防治。
（2）穀子鏽病可用15%粉鏽寧可濕性粉劑600倍液進行第一次噴藥，每隔7-10天后酌情進行第二次噴藥。
（3）谷瘟病發病初期田間噴65%代森錳鋅500-600倍液，或甲基託布津200-300倍液噴施葉面進行防治。
（4）穀子葉斑病發病初期噴灑36%甲基硫菌靈懸浮劑500-600倍液或50%多菌靈可濕性粉劑600-800倍液、30%鹼式硫酸銅懸浮劑400倍液，每隔10天左右噴灑1次，連續防治2-3次。
（5）穀子褐條病發病時，可用72%農用鏈黴素或20%噻菌銅懸浮劑進行葉面噴施，每隔7天噴1次，最好連噴2-3次。病害較重的地塊，要剝除老葉，除去無效莖以及過密和生長不良植株，通風透氣，降低温度。
2、穀子的害蟲主要有螻蛄、金針蟲、鑽心蟲（粟灰螟、玉米螟）、粟莖跳甲、黏蟲、粟芒蠅等幾種。不同的不同年份間這些蟲害的發生程度不同，不同蟲害的防治措施也不同，主要還是採用農業措施防治，但也可採用農藥，一般用的農藥有氯氰菊酯乳油、呋喃丹、可美雙可濕性粉等，具體使用根據具體的蟲害來確定。
