蘋果小葉病多發生在土壤瘠薄、透水性好的果園，由於含鋅量低，可溶性鋅鹽流失，發病嚴重；澆水降雨次數多，可溶性鋅流失量大；氮肥用量過多，導致樹體需鋅量增加；鹽鹼地PH值較高，鋅易被固定，不能被根系吸收。另外，土壤粘重，活土層淺，根系發育不良，小葉病發生重。所以增加鋅鹽供應或釋放被固定的鋅元素，是防治該病的有效途徑。具體做法如下：
增施有機肥，改良土壤，增加土壤中有機質含量，可降低土壤PH值，增加鋅鹽的溶解度，便於果樹吸收。對沙地、粘土地、鹽鹼地等條件不好的果園，應通過增施土雜肥的措施改良土壤，增加鋅元素和釋放被固化鋅元素，可促進根系發達，吸收功能提高。
土壤施鋅和植株噴鋅結合施基肥，每株樹追喂0.1 -0.15公斤 硫酸鋅，施後一般第二年見效，並可持續3年。有小葉病的果樹，發芽前樹上噴30倍硫酸鋅液肥，對當年防小葉病效果明顯。花後3周，發現有小葉病的病株，可用硫酸鋅500倍加尿素300倍混合液噴霧，對減輕病害有明顯的效果，連噴2年，病枝恢復率達95%以上，產量也明顯增加。
