秋收作業結束後，機手應及時做好水稻聯合收割機的維護保養和存放保管工作，使之技術狀態良好，這對延長收割機的使用壽命和下一年的使用很重要。聯合收割機維護保管要做好以下幾點：
一是選擇好存放地點。聯合收割機結構複雜、薄板件多、體積大，應採用室內或棚遮的方式保管，存放地點應乾燥、通風良好、排水暢通，存放場所應避開火源，並配有防火器材。庫房內不要存放酸、鹼、鹽、農藥、化肥、電池等有腐蝕性的物質。
二是清洗各零部件。對收割機外部進行清洗，注意清理滾筒凹板部件、籽粒推運器、穀粒抖篩動子部件、機動逐稿和割台傾斜喂入室等機器內部物體的附着物，然後拆下皮帶、電器等，用壓力水對整機進行沖洗。
三是進行潤滑保護。對聯合收割機的各密封軸承、含油軸承及所有帶油嘴的軸承統一注入新鮮的黃油，對撥禾輪、攪攏伸縮杆套、張緊螺桿等可調節螺栓、螺紋及動力定刀片等部位也應進行潤滑，軸承損壞的應及時更換並及時加註潤滑黃油。
四是蓄電池的存放。蓄電池冬春存放保管有兩種方式：一是原件存放，即拆下蓄電池放置到乾燥的室內，並定期檢查電解液中的水分蒸發情況，電解液麪不得低於極板高度，必要時可添加蒸餾水，保持蓄電池處於待貯狀態；二是卸下蓄電池單獨存放，將蓄電池完全放電，倒出電解液後用蒸餾水反覆沖洗，直到水無酸性為止，倒出水後晾乾擰緊孔蓋，密封通氣孔，可長期存放。
五是防止傳動帶傳動鏈老化。卸下全部的三角傳動帶，擦乾淨後，塗上滑石粉，用塑料袋裝好，掛在庫內的牆壁上；卸下傳動鏈條放入柴油中清洗乾淨，塗上機油或黃油，用塑料紙包好，存放在醒目的通風乾燥處。
六是發動機的保養。將發動機水箱、機體放水開關打開放淨水；放出油箱中的燃油；用塑料布將空氣濾清器，排氣管口，燃油箱加油口等部位包好，避免空氣中的水分和灰塵進入發動機內。向氣缸內注入適量的清潔機油，並轉動曲軸數圈。
