作用機理：草甘膦通過抑制烯醇丙酮基莽草素磷酸合成酶，阻止蛋白質合成來殺死雜草，而草銨膦通過抑制谷氨醯胺合成來滅殺雜草。
傳導方式：草甘膦為內吸傳導，而草銨膦為半內吸或觸殺滅生。
見效速度：草甘膦用藥7-10天后見效，而草銨膦用藥3天后見效。
安全性能：草甘膦藥後20-30天方可播種移栽，而草銨膦藥後1-4天播種移栽。
一、草甘膦和草銨膦的區別
1、作用方式不同
（1）草甘膦是甘氨酸類，作用機理——抑制烯醇丙酮基莽草素磷酸合成酶，蛋白質合成受阻;草甘膦為內吸傳導型廣譜滅生性除草劑，通過莖葉傳導到地下部，對深根雜草的地下組織破壞力強，能達到一般農業機械無法達到的深度。
（2）草銨膦是膦酸類，作用機理——積銨觸殺，抑制谷氨醯胺合成。草銨膦為膦酸類非選擇性傳導型除草劑，通過抑制穀氨酸合成酶這一植物的重要解毒酶作用，導致植物體內氮代謝紊亂，銨過量積累，葉綠體解體，從而使植物光合作用受抑制，最終導致雜草死亡。
2、傳導方式不一樣
草甘膦是內吸傳導滅生；草銨膦是半內吸或內吸很弱無傳導的觸殺滅生。
3、見效速度不一樣
草甘膦一般要7～10天見效；草銨膦一股為3天(正常氣温)。
4、安全性能不同
草甘膦一般藥後20～30天才可播種移栽，草銨膦在用藥後1～4天即可播種移栽。
二、草甘膦和草銨膦混用的優勢
1、草甘膦和草銨膦化合物類型、作用機理不同，復配理論上可行。
2、所以， 草甘膦和草銨膦復配可以提高雜草防治效果，擴大殺草譜，彌補草甘膦在殺草譜上的不足，對耐受草甘膦的部分惡性雜草如牛筋草、小飛蓬等效果好。
三、草甘膦殘留期多長
1、草甘膦的殘留期在6-7天左右，通常草甘膦進入植物6-7天后，大部分被代謝、分解掉了。
2、使用草甘膦時要注意草甘膦為滅生性除草劑，施藥時切忌污染作物，以免造成藥害；對多年生惡性雜草，在首次用藥後1個月再施1次藥，才可以達到理想防治效果；在晴天、高温時用藥效果好，噴藥後4-6小時內遇雨應補噴。
