油菜軟腐病病菌隨病殘體留在土中越冬，通過雨水、灌溉水、肥料、土壤、昆蟲等多種途徑傳播，從傷口侵入。多雨條件下易發病。連作田、土質黏重、低窪易積水、施用未腐熟的肥料、肥水不足、植株長勢較弱；高温多雨發病重。
病原為胡蘿蔔歐文氏菌胡蘿蔔軟腐致病變種，帶病植株、病殘體、有機肥、土壤和生產工具等都是侵染來源。病原可隨流水、澆（灌）水、土壤和土壤中的害蟲等傳播、擴散。病菌多從傷口、幼芽和根毛等處侵入，經維管束不斷向地上部轉移。土壤中的病菌可存活120多天，土温5℃以下可長期存活，15℃以上1～2天會死亡。病菌侵入油菜後會產生果膠酶，分解膠質物等致使細胞組織分解並崩潰。
