西瓜病毒病在田間主要表現為花葉型和蕨葉型兩種症狀。①花葉型初期病株頂端葉片出現黃綠色鑲嵌花紋，以後皺縮畸形，葉面凹凸不平，病葉變小。莖蔓節間短縮，纖細扭曲，座果少或不座果。②蕨葉型病葉狹長，皺縮扭曲。植株生長緩慢，矮化，頂端枝葉簇生。花器發育不良，嚴重的不能座瓜。
西瓜綠斑駁花葉病主要為害葉、果梗及果實。苗期染病新葉上現不規則形褐色和綠色斑駁，症狀較明顯。成株染病症狀不明顯。果梗、果實染病初生褐色斑，剖開病果產生赤褐色油浸狀病變，病部腐敗發臭，無法食用。
病株呈系統花葉症狀。頂部葉片現濃淡相間的花葉，病葉變得窄小即小葉，或皺縮畸形。輕病株尚結瓜，但瓜小，發病重是結瓜少或不結瓜，植株萎縮，莖變短，新生莖蔓纖細扭曲，花器發育不良，難於座瓜。
