西瓜病毒在田間主要表現為花葉型和蕨葉型兩種症狀。花葉型：初期頂部葉片出現黃綠鑲嵌花紋，以後變為皺縮畸形，葉片變小，葉面凹凸不平，新生莖蔓節間縮短，纖細扭曲，座果少或不座果。蕨葉型：新生葉片變為狹長，皺縮扭曲，生長緩慢，植株矮化，有時頂部表現簇生不長，花器發育不良，嚴重的不能座果。發病較晚的病株，果實發育不良，形成畸形瓜，也有的果面凹凸不平，果小，瓜瓤暗褐色，對產量和質量影響很大。
西瓜受害後，生長緩慢，葉片變形，植株矮化，花器發育不良，發病重的難以坐瓜，早期發病輕或後期發病的雖然可坐瓜，但生長緩慢，瓜小且品質差，畸形、瓜瓤變硬，失去商品價值，直至植株死亡，嚴重影響產量。西瓜病毒病主要有花葉型、蕨葉型、皺縮型、黃化型、壞死型和複合侵染混合型等。
