棉籽種皮堅韌，而且表面有一層短絨，如果幹燥種子直播，比較乾燥的土壤墒情會影響萌動。勢必造成部分種子出芽較晚，那樣就會造成種苗生長速度不同，影響將來的統一開花結鈴和成熟收摘。
浸種催芽有利於一播全苗，而且早出苗早發育。用冷水浸種24小時，撈出兩小時，攤在席上二、三寸厚進行曬種，曬至籽毛變白時，用塑料布蓋好催芽，待50%棉籽露芽時即可播種。
棉花種子還可以進行快速發芽。
（1）高温悶種法：將棉籽用55-60℃的温水浸3-4小時，倒去水後悶種子3-4小時（保持30℃左右温度），然後用濕毛巾捲起或置於沙發芽牀內，在30-35℃的温度條件下培養，經2晝夜即可檢查發芽率。
（2）高温蓋沙法：將棉籽浸入濃硫酸內，並不斷攪拌，浸入的時間以除盡短絨為標準。然後取出棉籽放在清水中洗滌2-3次，再浸入1％的小蘇打溶液內洗滌，使酸中和，再用清水洗乾淨，隨後用鋒利的小刀把棉籽較寬的一端切去一部分種皮，或劃破種皮。將處理過的棉籽播在濕沙內，使切口朝下，壓入沙中，並在上面蓋一層沙布和濕沙。加蓋後，放入35℃的温度下培養2晝夜，即可計算髮芽率。
