患囊蟲病的豬屠宰後，在患豬的肌肉如咬肌、舌肌、膈肌、肋間肌、心肌以及頸、肩、腹部等處的肌肉中，外觀可見白色半透明，如蠶豆大小囊泡狀的豬肉囊尾蚴，囊泡內有一小米粒大小的白點，人們俗稱患囊蟲病豬的肉為米豬肉。
豬囊蟲病的檢疫主要有宰前檢疫和宰後檢疫。生前診斷比較困難，可以檢查眼瞼和舌部，查看有無因豬囊蟲引起的豆狀腫脹。觸摸到舌根和舌的腹面有稍硬的豆狀疙瘩時，可作為生前診斷的依據。宰後檢驗咬肌、腰肌等骨骼肌及心肌，檢查是否有乳白色的、米粒樣的橢圓形或圓形的豬囊蟲。鈣化後的囊蟲，包囊中呈現有大小不一的黃色顆粒。現行的肉眼檢查法，其檢出率僅有50%～60%，輕度感染時常發生漏檢。
宰後檢疫。現場剖檢。病豬胴體的肉色通常比較暗淡,在瘦肉、肥肉以及五臟器官上都可能存在一定數量的米粒狀囊包。剖檢時,重點是對豬胴體的咬肌、膈肌和深腰肌等處進行切割檢查,通常切割厚度適宜控制在1cm,每間隔1cm切一刀,4~5刀之後對切面進行仔細觀察,如果發現肌肉上存在水泡狀物,呈石榴籽大小,就能夠確診為囊包蟲。對內臟進行剖檢,發現腎臟和輸尿管周圍的結締組織明顯增生,並存在較多乳白色的黃豆大小的包囊,呈圓形或者橢圓形,且囊內含有大量無色的透明液體,且囊壁內層連接有一個白色球形的懸垂狀頭節,也能夠判斷為囊蟲。
國家肉食品衞生標準規定，豬肉切面40平方釐米內有3個以上囊蟲者，豬肉只能做工業用，不可食用。要加強農貿市場的獸醫衞生檢驗，對含囊尾蚴的豬肉嚴格按肉品衞生檢驗的有關規定處理。
診斷以糞檢見有排出絛蟲節片為主要依據。豬囊蟲病可引起腦病、癲癇、眼病、皮下組織與肌肉疾病，活體組織檢查可確診。
