紅薯最適合的儲藏的温度在9℃到15℃之間，而且對濕度要求也很高。太乾燥，水分會很快流失，太潮濕，又會受到病菌的侵擾，很快腐爛。一般説來，紅薯的儲藏間裏的空氣相對濕度一般要在85%到95%之間。有條件的地方，可以利用地窖進行儲藏。沒有地窖的地方，可以在乾燥的地方挖洞儲藏。也可以利用防空洞等來進行儲藏。
地窖位置應選擇在地勢較高、土質以紅壤土為主的地方。地窖的深度以3米左右為宜，紅薯的兩個儲存洞高度不低於1.8米，長寬不低於2.5米，這樣的地窖可貯藏鮮紅薯4000公斤左右。
紅薯入窖前，舊窖洞要重新挖一遍，以見新土為準，舊土運出窖外。如果窖內比較乾燥，可潑幾桶清水，以保持窖內濕潤。存放紅薯前要用50%多菌靈可濕性粉劑1500倍液或50%硫磺懸浮劑800倍液均勻噴灑地窖，以達到殺菌消毒的目的。
貯藏應儘量選擇無病菌侵染，無病蟲危害的紅薯，搬運入窖時要輕拿輕放，注意不要損壞紅薯皮。每存150公斤左右紅薯，用“紅薯保鮮劑”稀釋液均勻噴一遍。
紅薯按大小分級堆放，以方便倒窖，紅薯堆放高度以離洞頂60釐米左右為宜，以利紅薯呼吸散熱。
用以上方法貯藏的紅薯，保鮮時間可達8個月以上，紅薯完好率可達96%。
