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主要為害果實及莖蔓。果實染病,殘花部呈水浸狀腐爛,然後長出白色菌絲,菌絲上散生鼠糞狀黑色菌核。莖蔓染病,初呈水浸狀,病部變褐色,後也長出白色菌核和黑色菌核,病部以上葉、莖蔓枯死。
西葫蘆菌核病常見發病部位是果實及莖蔓。
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