苗期管理：
棉花苗期是以長根、莖、葉為主的營養生長階段，並在2～3片真葉期，開始花芽分化，進入孕蕾期，棉苗轉入營養生長與生殖生長的並進生長階段。根系是棉花苗期的生長中心，現蕾時主根下扎達20～30cm，上部側根橫向擴展達20cm左右，是根系建成的重要時期。
影響棉花生長的外在因素，第一是温度。棉花苗期，氣温偏低，並有寒流侵襲。幼苗抗逆性差，低温導致病苗、死苗和弱苗晚發。第二是光照。如遇連陰多雨天氣、間定苗不及時或受間作套種作物的遮陰影響，均易形成高腳弱苗，推遲現蕾。第三是肥料。該階段需肥量少，對肥料反應十分敏感，缺N抑制營養生長，影響花芽分化，延遲現蕾；缺P抑制根系生長髮育，缺K則光合作用減弱，容易感病。但肥料過多，特別是N肥過多，容易引起地上部旺長，花芽分化延遲。第四是水分。棉花苗期需水量少，土壤含水量以保持田間最大持水量的55%～65%為宜。這一時期土壤水分略少一些，有利於紮根，促進壯苗早發。
苗期主要蟲害：
棉花苗期主要蟲害：棉薊馬、棉葉蟎、棉蚜、棉盲蝽。棉薊馬成蟲和若蟲多集中在棉花子葉和生長點處、吸取汁液，受害處形成白色有光澤的斑痕，葉片變厚變脆；危害後出現“多頭棉”、“散頭棉”所以應早發現、早防治；一般棉薊馬造成多頭棉和散頭棉，多是棉花齊苗至2片真葉期，棉花3片真葉以後就不需要用藥防治棉薊馬了。棉葉蟎和棉蚜多為中心株，或小點片發生期，應該早發現，早防治，圍點打圈，控制其蔓延危害。對棉盲蝽一般在棉花6片真葉期，針對田間棉盲蝽若蟲和成蟲期進行集中防治。
苗期主要病害：
炭疽病：莖部出現紅褐色梭型條斑，隨後發黑變爛，葉片邊緣產生半圓形褐色病斑；防治：代森錳鋅、多菌靈、五氯硝基苯；
立枯病：近地面的莖基部由黃褐色變成黑褐色，並逐漸向下凹陷腐爛，使發病部位變細萎縮；防治：多菌靈、代森錳鋅、退菌特；
褐斑病：受害棉苗葉片出現針尖大小紫紅色斑點，病斑擴大後呈黃褐色，病組織容易脱落，呈穿孔狀，嚴重時造成葉片脱落；防治：代森錳鋅、百菌清；棉花苗期應及時中耕、鬆土降濕，增加土壤透氣性，減輕病害的發生。
