1、進行輪作換茬，避免連年種植。
2、田間管理：小水勤灌韭菜疫病菌靠水傳播，所以如灌大水，根部吸水能力弱，室內濕度過大，疫病發生。合理施肥在施足底肥的基礎上，注意氮、磷、鉀配合施用。清除病殘體病殘體是傳播韭菜疫病的主要病源。
3、藥劑防治:發病初期及時噴藥。如發病較重，可每隔10－15天噴一次，連噴2—3次。可選用72.2%普力克水劑600倍液、72%杜邦克露可濕性粉劑700倍液、50%稀酰嗎啉可濕性粉劑1500倍液、72%甲霜靈錳鋅500倍液等噴霧，隔7天左右1次，連噴2－3次可有效控制病情蔓延。
