a.要實行3-5年以上的輪作制度，減少土壤中殘留的病原菌。b.應選擇排水通暢的地塊栽培，或採取短畦、溝澆等栽培措施，切忌漫大水，降低土壤含水量。c.勤中耕，及時整枝打杈，防止葉蔓生長過密，通風不良。有條件的地區可採取鋪草栽培或全覆蓋栽培。d.預防用藥：在預期發病時，益唯哚+丹彤套餐兑水15公斤，每7—10天1次。治療用藥。
品種選擇：在近年國內推介的60多個西瓜品種中，對疫病表現抗耐病性的有湘西瓜3號、4號和6號，湖南沁無籽西瓜、瓊雪、慶紅寶等。至於一些一般表現抗病性較強的品種，如京欣1號、鄭雜5號、新紅寶、金花寶、特早佳龍、雲中1號、長密1號和2號、中育1號、夏寶3號、八豐收3號、瓊酥等是否也抗疫病有待各地進一步觀察鑑定。
切忌在西瓜地收穫之後與瓜果類蔬菜進行輪作，發現患病瓜應及時清除，防止傳染。在有瓜發病時可噴灑藥劑進行防治。例如霜脲錳鋅等，一個星期噴灑一次，持續一個月左右即可。
種子消毒，用55℃恆温水浸種15分鐘;也可用50%複方多菌靈膠懸劑500倍液浸種30分鐘,水洗後催芽育苗或直接播種。發現病株後開始噴藥,可選用58%雷多米爾錳鋅可濕性粉劑500～700倍液、70%百德富可濕性粉劑500～700倍液、64%殺毒礬可濕性粉劑600倍液、72%克露可濕性粉劑600～750倍液。
用30%霜黴威+25%氟嗎啉+5%惡唑菌酮三元復配而成的疫霜快淨，發病初期，用800倍液噴霧，病情嚴重時，可適當增加藥量和噴霧次數，用藥間隔期9-13天；或用50%烯酰嗎啉、15%氟嗎啉、5%多抗黴素三元復配的水分散顆粒劑無霜，在預防和發病初期，噴霧使用濃度500-800倍藥液。病情嚴重時，可適當增加藥量和使用次數，7-10天噴施一次。
防治方法：選用抗病品種後用新高脂膜拌種（可與種衣劑或是農藥混用），保濕保温，驅避地下病蟲。隔離病毒感染，增強萌芽吸脹功能，提高種子發芽率。選擇排水良好田塊，採用深溝高廂或高壟種植，雨後及時排水，整地下種後用新高脂膜600-800倍液噴霧土壤表面可保墒防水分蒸發，防曬抗旱、保温防凍，隔離病蟲源並窒息式消滅，提高種子出苗率。
選擇抗性強的品種，和排水好的地塊，採用高壟栽培，種植密度要合理。種子播種前要注意消毒。發病初期要及時防治。防治可以選用吡唑醚菌酯，甲霜靈，甲霜靈錳鋅，精甲霜靈，氰霜唑，多考喹啉銅，稀酰嗎啉，精甲百菌清等。嚴重時可以採用上述藥劑噴施加灌根處理。
西瓜疫病的防治方法主要以農業防治和化學防治為主。首先選用抗病品種，對種子進行消毒處理。實行3年以上輪作，控制澆水，及時拔除病株燒燬，雨季加強排水。利用黑籽南瓜、西葫蘆、瓠瓜作砧木嫁接西瓜品種。加強肥水管理，再結合化學藥劑進行防治。
西瓜定植後、開花期，選用80%代森鋅可濕粉劑600-800倍液、或75%百菌清可濕粉劑500-700倍液、或50%克菌丹可濕粉劑400-500倍液、或40%乙膦鋁可濕粉劑300倍液等噴藥預防。發病初期，選用25%嘧菌酯懸浮劑1500-2000倍液、或30%醚菌酯懸浮劑2000-3000倍液、或72%霜脲·錳鋅可濕性粉劑600-800倍液、或50%甲霜·銅可濕性粉劑600-800倍液、或53%精甲霜·錳鋅水分散粒劑600-800倍液噴霧防治，間隔7-10天1次，連續2-3次。也可用15%百·烯酰煙劑，或10%百菌清煙劑薰煙防治。
加強肥水管理：施用充分腐熟的農家肥，禁止施用含有西瓜秧蔓、葉片、瓜皮的圈肥。提倡配方施肥，不要偏施氮肥。西瓜苗期是需肥臨界期，這一時期容易產生磷素和鉀素缺乏。
