帶菌種子是病害遠距離傳播的主要途徑。病菌從寄主根部傷口或根毛的頂端細胞間侵人，帶菌種子萌發時病菌可直接侵人幼根。病菌侵入寄主後，以菌絲在寄主的根和莖部的薄壁細胞中蔓延，進人維管束後分泌毒素，在導管內積累，堵塞導管，阻礙水分運輸，從而引起植株萎蔫枯死。發病的主導因素是温、濕度，温度在8~34°C均可發病，以24〜32°C為最適，而苗期在16~18℃時發病最多。
西瓜枯萎病是一種土傳病害，通過帶菌種子，土壤，肥料，灌溉水，昆蟲及為傳播。
西瓜枯萎病俗稱“死秧病”，發病初期，病株莖蔓上的葉片自基部向前逐漸萎蔫，似缺水狀，中午更明顯，最初1、2日，早晚尚能恢復正常，數日後，植株萎蔫不再恢復，慢慢枯死，多數情況全株發病，也有的病株僅部分莖蔓發病，其餘莖蔓正常。發病植株莖蔓基部稍縊縮，病部縱裂，有淡紅色（琥珀色）膠狀液溢出，根部腐爛變色，縱切根頸，其維管束部分變褐色。
