低温高濕的棚室環境，蔬菜最容易引發灰黴病。而灰黴病主要從殘花部位開始侵染，一旦暴發，病情又會迅速蔓延，會造成大面積減產，因此對於此病要早防早治。
首先，調環境，防灰黴。由於灰黴病發病的適宜温度為20℃~25℃，相對空氣濕度為90％以上，所以要通過提温降濕來防控灰黴。在棚內相對濕度較高的時間段，儘量提高棚温，避開灰黴病的發病適温。此外，還可以通過膜下澆小水、操作畦覆蓋稻草等措施降低棚內濕度。
其次，拾花和藥劑噴花相結合。先拾花，通過拾殘花來降低灰黴病的發生，拾花後用噴壺配製50%的撲海因1000倍液，再進行噴花，避免拾花不全帶來的隱患。
另外，使用菌核淨薰棚。閉棚前，使用菌核淨煙劑薰煙。用量和薰煙時間根據作物而定，如番茄可畝用250克，薰8~10小時；豆類和茄子畝用200克，薰6~8小時。實踐證明，這種方法可有效殺死棚內植株、土壤及牆壁上的病菌孢子，減少病菌孢子殘留，預防病害發生。
