生物農藥由於無毒、不污染環境以及病蟲害不易產生抗藥性等優點，被人們稱之為綠色農藥，具有廣闊的開發前景。但在使用上必須注意四點。
一是温度。生物農藥噴施的適宜温度在２０℃以上。因為生物農藥的活性成分是蛋白質晶體和有生命的芽孢，低温條件下芽孢在害蟲體內繁殖速度極慢，蛋白質晶體也不易發生作用。試驗表明：在２５—３０℃條件下施用生物農藥，其藥效比在１０—１５℃時施用高兩倍左右。
二是濕度。使用生物農藥，環境濕度越高，藥效越高，尤其是施用粉狀生物製劑，只有在高濕條件下藥效才能得到充分發揮。其原因是生物農藥細菌的芽孢不耐乾燥的環境條件。因此，噴施細菌粉劑宜在早晚有露水的時候進行，以利於菌劑能較好地粘在作物的莖葉上，並促進芽孢繁殖，增加與害蟲接觸的機會，提高防治效果。
三是陽光。陽光中的紫外線對芽孢有殺傷作用，陽光直接照射３０分鐘，芽孢可死亡５０％，照射１小時則死亡率高達８０％。因為紫外線的輻射對蛋白質晶體也有變形降效作用，所以使用生物農藥宜選擇下午４時以後或陰天全天進行。四是雨水。中到大雨會將噴灑在作物葉片上面的菌液沖刷掉，降低藥效，但如果在施藥後５個小時內下小雨，則不但不會降低藥效，反而可提高防效。因小雨對芽孢活動有利，能加快滅蟲效果。
