温度偏高、多雨的年份發病重；田塊間與易發芹菜軟腐病的作物連作（土壤中病原細菌積累多）、地勢低窪、排水不良的發病較重。
芹菜軟腐病是由細菌胡蘿蔔軟腐歐氏桿菌感染所導致，主要隨病株殘存構造遺留在田間或堆肥中越冬。在環境條件合適時，病菌借雨水、澆灌水及傳病蟲豸如黃條跳甲、菜青蟲等傳播，從植株根部的天然裂口、機械造成的傷口、害蟲所致傷口侵入，並進入導管潛伏滋生，引起首次、再次感染。
温度偏高，多雨的年份發病重。
年度間春、夏、秋季温度偏高、多雨的年份發病重；田塊間與易發芹菜軟腐病的作物連作（土壤中病原細菌積累多）、地勢低窪、排水不良的發病較重；栽培上有機基肥不足、夏秋季播種過早、種植過密、通風透光差、氮肥施用過多則發病重。
主要隨病株殘存構造遺留在田間或堆肥中越冬。在環境條件合適時，病菌借雨水、澆灌水及傳病蟲豸如黃條跳甲、菜青蟲等傳播，從植株根部的天然裂口、機械造成的傷口、害蟲所致傷口侵入，並進入導管潛伏滋生，引起首次、再次感染。
芹菜軟腐病病菌可在土壤中，病殘體等進行越冬，第2年適宜的時期進行感染，軟腐病病菌傳播途徑多，可順灌溉水，雨水，糞肥等進行傳播，病原菌一般通過農事操作，地下害蟲，低温凍害等造成的傷口入侵。
