瞭解根系生長規律，掌握施肥深度，合理用肥，改良土壤結構，防止土壤酸化，充分提高肥料的利用率，增強樹勢，解決果樹因缺素引起的多種生理病害，是當前果樹管理、提高果品品質的重要舉措。
蘋果的根系水平伸展約是樹冠的1．5～3倍，深度在80釐米左右的土層內，主要根羣集中在20～60釐米的土層內。蘋果的根系沒有自然休眠期，只要土壤温度高於零度，濕度又合適，便可持續生長。根系生長活動及髮根數量受砧木種類、地上部養分迴流多少的影響。結果多的年份養分迴流少，根系生長弱而髮根也少，來年就會減產。因此，生產上一方面要控制產量，一方面要加強樹體管理、保護葉片，促使有更多的養分迴流，以保證根系的正常生長。根系生長受温度、水分、通氣狀況等環境因素的影響。蘋果根系在土温3℃時開始生長，7℃以上時生長加快，20-24℃最適於根系生長。土壤相對濕度60～80％、含氧量10～15％、土壤pH值6.5―7．0時根系活躍。因此要通過改良土壤，創造良好的土壤環境，來促進根系生長。
要根據根系的生長規律及整個果樹的營養需求規律合理用肥。蘋果摘收後抓緊施肥，建議畝8-10包4%的有機生物菌肥，加硅鈣肥等中微量元素肥。這樣能適當斷根，促進新毛細根產生；深度40-60公分，把有機肥與中微量元素肥這類不容易移動的肥料集中使用在根系的密集區，利於根系快速吸收，更主要的是利於調理土壤酸化，同時有機肥深施，可以把淺施的化肥下滲的部分吸收並保存，保肥、保水，改善根系土壤的團粒結構，容易新根的生成，促進養分的吸收。提高肥效。
