藍莓根腐病應以預防爲主，在育苗時用先科高錳酸鉀每平米2-4克，進行噴淋。移栽前後用先科高錳酸鉀，稀釋1500倍液，每株200毫升，進行灌根。在定植成活期和開花前，並配合噴施新高脂膜800倍液增強藥效；如發現病株的田塊採用淋根防治。
（1）合理加強土肥管理。首先去掉覆蓋在植株根冠上的低有機質土壤，在秋天時，施用有機肥，以增強植株的樹勢，保持良好的透風條件。（2）水分的科學管理。在合適的時間裏進行科學灌水，灌水時須注意控制灌水量，儘量避免出現土壤水分過多或過乾的情況。夏天時，下雨後要加強排水措施，儘快讓地表達到乾燥的狀態。（3）病株、病穴處理。當藍莓根腐病發病率在50%以下時，儘快將地裏的病株和死亡植株清理掉，同時要用福爾馬林對根腐病病株的穴徹底消毒，10天以後纔可以補栽藍莓植株，與此同時用惡黴靈或多菌靈藥液來澆灌植株根部；
