是指採用生物技術將秸稈轉化為農作物所需要的二氧化碳、熱量、抗病孢子和養料。達到改善作物的生長環境，促進作物生長髮育，提高植物光合效率，降低生產成本，獲得高產優質無公害農產品的目的。應用方式有內建式、外接式和內外結合式3種模式。6。
秸稈在微生物菌種、淨化劑等的作用下，定向轉化成植物生長所需的CO2、熱量、抗病孢子、酶、有機和無機養料，進而實現作物高產、優質和有機生產。
秸稈生物反應爐技術以秸稈替代化肥，以植物疫苗替代農藥，密切結合農村實際，促進資源迴圈增值利用和多種生產要素有效轉化，使生態改良、環境保護與農作物高產、優質、無公害生產相結合，為農業增效、農民增收、食品安全和農業可持續發展，提供了科學技術支撐，開闢了新的途徑。
