1.防浸種時間不足，影響催芽整齊度稻種吸足一定水分後，體積膨脹，細胞改變原來的休眠狀態，開始伸長和分化。浸種時間的長短，要根據水温的高低而定。當水温10℃時需90小時才吸足水，需浸種三四天；當水温達到30℃時需40小時，浸種一二天即可。浸種時吸水不夠，種穀出芽就不齊，但也不能浸種時間過長。催芽時仍需保持稻種足水狀態（以種皮濕潤，谷堆不見明水為宜）。如種子缺水，根長芽短；水分過多則芽長根短，達不到根芽同長的壯芽要求。
2.防種子露白前過多翻動
發芽所需最適温度為30℃～32℃，最高温度為40℃。低於最低温度時萌芽緩慢，甚至停止，時間過長會引起爛種；高於最高温度時則發芽受阻，且有“燒芽”的危險，所以催芽時要嚴格掌握温度。如果種子露白前過多翻動導致谷堆裏熱氣散失，達不到催芽所需的適宜温度要求，不利於出芽。一般是破胸前温度宜高，破胸後應立即降温，保持30℃～32℃適温。因此，浸種結束上堆後10多個小時不宜翻動，讓其保温催稻種露白。
3.防淋水過多淋水過多，會造成谷堆裏缺少氧氣，不能滿足芽谷的呼吸需要，產生酒味，穀殼外面發黏，造成出芽不快、不齊和不壯。要保持谷堆內濕度適當，一般谷堆表面的穀殼不發白，就不需淋水，始終保持種穀既潮濕而又輕爽的狀態，達到濕度與供氧兩者協調的要求。
4.防露白後不及時檢查
露白後要勤檢查，根據温度情況及時翻堆和適當淋水。最好在稻種中插1支温度計，定時查看種子温度，以防出現40℃以上的高温而發生“燒芽”現象。
5.防芽谷不鍛鍊稻種催好芽後，如果播熱谷下田，容易“傷風感冒”，影響成秧率和壯苗率。因此，齊芽後，應攤薄煉芽一二天，使谷芽逐漸適應環境的轉換。
