1、提早播種。青枯病一般6月上中旬發生，為了避免發病高峯期與結果盛期相遇，可提早播種。2、選擇排水良好的沙壤土栽培。土壤深翻後噴灑新高脂膜800倍液，給土壤，保温保墒，有利於種子萌芽生長。3、實行三年以上輪作。青枯病可為害多種茄科作物，凡前作是番茄、茄子、辣椒的，均不宜種辣椒。4、注意排水。青枯病菌可隨水流傳播，應用高壟窄畦栽培，注意及時排水，畦內不能積水。5、整枝、鬆土、追肥等工作，應在發病期前完成，發病以後，特別注意不能鬆土鋤草，如有雜草，只能用手拔除，以免傷根。6、發現病株，及時拔除，穴內及鄰近土壤噴灑護樹將軍，防止蔓延。
選育和種植抗耐病良種是防治辣椒青枯病最經濟有效的辦法。
加強田間肥水管理及時防治工作。
①選用抗青枯病的品種，如辣優15號、粵紅1號。
辣椒青枯病應以預防為主，建議使用新型蛋白農藥“信號施康樂”進行預防，新型蛋白農藥“信號施康樂”能從內在激發辣椒植株對青枯病、炭疽病、疫病等常見病害的主動防禦能力，提升植株對病害抵抗能力，防效達70%以上。
辣椒青枯病的防治必須因地制宜，綜合實行各種有效的防治措施。綜合防治策略是：以抗病品種為基礎，田間管理為重點，在控制菌源前提下，加強農業措施，輔以藥劑防治。
1、提早播種。2、選擇排水良好的沙壤土栽培。3、實行三年以上輪作。4、注意排水。5、整枝、鬆土、追肥等工作，應在發病期前完成，發病以後，特別注意不能鬆土鋤草，如有雜草，只能用手拔除，以免傷根。6、發現病株，及時拔除，穴內及鄰近土壤噴灑護樹將軍殺菌消毒，防止蔓延。
青枯病細菌性病害用中生黴素，葉枯唑乙酸素，枯草芽孢桿菌提前預防。種植前提前土壤處理一下。
一、培育壯苗。壯苗的抗病能力強，是保證齊苗的基礎。二、移栽時儘量減少植傷。一是移苗時輕拿輕放，儘量減少斷根；二是栽種時一定要順根，不能為了趕工讓根擠成一團。三、嚴格實行輪作制。耕作制度實行與非茄科作物輪作或水、旱輪作。四、在定植後至開花結果期及早淋藥預防，比發病後施藥對預防和減輕發病效果更好。這期間定期或不定期淋施或結合溝灌，用高錳酸鉀600倍液，或硫酸銅1000倍液，或銅氨液600～800倍液，2～3次或更多，發病後繼續挑治，封鎖發病中心，可減輕危害。
加強水肥管理，做好病蟲害防治。
