當春季回暖早、田間濕度大，特別是小麥開花期雨水多的年份對赤黴病的發生極為有利。當栽培管理粗放、病殘體大量留在田裏、或過量偏施氮肥造成小麥密度過大，麥苗貪青徒長易倒伏的地塊，只要條件適宜，就容易發病。
過度密植氮肥偏施田間濕度大等容易發病。
1)高峯期。小麥齊穗後20天內最容易感病，以揚花期感病率最高。(2)氣候因素。高温高濕病情發生迅速。開花灌漿階段悶熱、連續降雨、潮濕多霧的天氣，發病重。(3)栽培因素。遲熟、不耐肥的品種，發病重。田間病殘體數量大，帶菌量高的地塊，發病重。地勢低窪，排水不良，土質粘重，偏施氮肥，田間潮濕鬱閉，發病重。
主要引起苗枯、穗腐、莖基腐、稈腐和穗腐，從幼苗到抽穗都可受害。其中影響最嚴重是穗腐。苗腐是由種子帶菌或土壤中病殘體侵染所致。先是芽變褐，然後根冠隨之腐爛，輕者病苗黃瘦，重者死亡，枯死苗濕度大時產生粉紅色黴狀物（病菌分生孢子和子座。
