流產胎兒腦水腫，皮下血樣浸潤，肌肉似水煮樣，腹水增多；木乃伊胎兒從拇指大小到正常大小；肝、脾、腎有壞死灶；全身淋巴結出血；肺瘀血、水腫。子宮粘膜充血、出血和有粘液。胎盤水腫或見出血。公豬睾丸實質充血、出血和小壞死灶；睾丸硬化者，體積縮小，與陰囊粘連，實質結締組織化。
豬流行性乙型腦炎的病理變化：母豬子宮內膜充血、水腫，黏膜表面覆蓋有大量黏性分泌物，刮除後可見黏膜糜爛和小點狀出血。早產仔豬多為死胎，死胎大小不一，黑褐色，小的幹縮而硬固，中等大的茶褐色、暗褐色，皮下出血、膠樣浸潤，發育到正常大小的死胎，多因腦水腫而頭部腫大，皮下彌散性水腫，腹水增多，腦、脊髓膜充血、出血。
