秋季蔬菜苗牀消毒，有提高成苗、培育壯苗、降低病蟲基數、減少用藥對環境污染的效果。
高温消毒法高温消毒是投資省、不產生藥害、農户易掌握的一種方法。在育苗前夕，搶晴天對苗牀深耕曬田2－3天，再將地整平，鋪黑、白膜，利用中午的強光和高温烤苗牀2－3天，使苗牀温度達到50℃以上，殺死土中病蟲。
藥物噴灑法每平方米用72.2%普力克水劑6－8毫升，或50%多菌靈可濕性粉劑８克，或將多菌靈配成1000倍液，按1000公斤營養土用50－60克多菌靈的比例進行噴灑，噴灑後用膜密封2－3天，可殺死土中多種病菌。
毒土法（1）耕地後，每平方米苗牀用10克殺毒礬拌細土10公斤撒在土壤中，半個月後再整地。（2）每平方米苗牀用50%多菌靈10克拌幹細土，播種時，將其中的1/3作墊籽土，種子夾在中間，餘下的2/3作蓋籽土，然後澆適量水，做到灑水不見水，保持土壤濕潤，以免過乾產生藥害，過濕降低藥效。以上兩種方法用於殺菌，可任選一種，按標準用藥，規範操作。（3）針對苗牀易發生螻蛄、蚯蚓、鼠害的情況，在苗牀填營養土前，每平方米苗牀可用2.5%敵百蟲粉4－5克加細土0.5－1公斤撒入苗牀，以消滅地下害蟲。
