木薯地裏有毛草、闊葉雜草等，人工除草比較麻煩。種植木薯後，如遇上天氣冷涼或乾旱等因素，木薯會延遲到15天左右出苗，反之，天熱地溼則較早出苗，一般在植後7-10天，木薯就陸續出苗。趕在木薯出苗前，主要可用乙草胺和草甘磷防治雜草。如是雜草茂盛和有小灌木，則只用草甘磷即可，死後的雜草自然覆蓋地表，可抑制雜草種子；乾淨無雜草地，單用乙草胺即可；而有較多細小雜草的新地，則應混合乙草胺和草甘磷，利用草甘磷殺死地表雜草，而乙草胺抑制地下雜草種子。
乙草胺是旱地萌前除草劑，能殺死雜草種子，由於木薯種莖粗大，木薯芽較耐藥，爲了保持較長藥效，一般木薯地的乙草胺用藥量稍高爲佳，一般按每桶水（人工噴霧器約15公斤水）配40-60克50%乙草胺乳油；草甘磷是滅生性內吸傳導型除草劑，在土壤中能迅速分解失效，無殘留作用，對未出土的木薯無害，一般按每桶水配0.3-0.5公斤10%草甘磷水劑。根據土壤、氣候、整地情況、雜草老嫩、多少、是否惡性雜草等具體情況，增減藥量後，按每畝3桶水均勻噴灑雜草，並加洗衣粉和少量尿素等增加藥效。另外，由於農忙或疏忽，造成已有部分木薯萌發出土，可用膠杯或塑料袋蓋苗後，噴除草劑。
當木薯的低位莖部落葉後，可用克蕪蹤低噴除草，克蕪蹤是速效滅生性除草劑，主要觸殺，兼有一定內吸，但無傳導作用。對植物綠色組織具有極強的枯殺作用，而對非綠色的莖部不起作用，在噴入土中後，便迅速與土壤結合鈍化，無殘留，不會傷害植物的根部，因此，它只能殺死地上綠色部分，對地下塊根無效，所以，要注意不要噴到綠色木薯莖葉。一般按每桶水配50-80克20%克蕪蹤水劑噴灑雜草，可加洗衣粉和少量尿素等增加藥效，每畝噴3桶水。
