严格选用无病菌新土配营养土育苗。实行轮作。与禾本科作物轮作可减轻发病。秋耕冬灌，瓜田秋季深翻25～30厘米，将表土病菌和病残体翻入土壤深层腐烂分解。土地平整，适期播种。一般以5厘米地温稳定在12～15℃时开始播种为宜。加强田间管理。出苗后及时剔除病苗。雨后应中耕破除板结，以提高地温，使土质松疏通气，增强瓜苗抗病力。
西瓜苗期立枯病可用敌磺钠兑水防治。
西瓜立枯病的防治方法主要有播种前进行种子处理，严格选用无病菌新土配营养土育苗；实行轮作，适期播种，加强田间管理，出苗后及时剔除病苗等。此外，发病后还可以采取化学防治或生物防治。
选择抗病品种丶种子士壤消毒、忌连作丶防水渍…。
西瓜立枯病可进行土壤处理或种子包衣。
