防凍：冬季要注意泥土的防凍，將温度控制在3-10度左右。
覆蓋：需在盆底墊上一層塑料薄膜加枯草，厚度大約3釐米左右即可，能起到防雨雪、保暖的作用。
放置：準備一個大缸，在缸內放置種藕和泥，並填充泥沙，然後灌水。
一、防凍
每年11月至次年3月是碗蓮的休眠期，除了藕在泥中越冬外，其餘部分全部會枯死，所以冬季要注意泥土的防凍。最佳越冬温度為3-10度。南方地區無需保護就可以越冬，北方需要通過覆蓋塑料薄膜加枯草、放在地窖等方法進行保護。
二、覆蓋
在盆底鋪上塑料薄膜和枯草，厚約3釐米，用同樣的方法在盆底覆蓋塑料薄膜和枯草。上下兩層塑料膜主要起到防雨雪、保暖的作用，厚度根據當地氣温降低適當加厚。
三、入窖
將藕放在地窖過冬。入冬前，翻盆取藕，儘量保留藕根上的淤泥，不要折斷藕與藕之間的連接面，以免感染。隨即入窖，放入準備好的缸中，缸上蓋草，薄薄一層就好。貯藏期間經常檢查，適時向缸面灑水，保持濕潤。
四、放置
室內温度達到10℃以上，準備好大缸。在缸內放置15釐米的藕和泥，填充15釐米厚的沙，間隔堆積，直到離缸口5釐米為止，然後灌水。保持缸內水分充足，呈泥湖狀。
