聯合收割機的調整不當可能是導致脱粒不淨且碎籽多的主要原因之一。收割機的脱粒器需要根據不同的作物和濕度進行調整，以確保有效的脱粒和清潔。如果調整不當，可能會導致脱粒不完全，殘留的碎籽增多。因此，農民在使用聯合收割機前，應該仔細學習和掌握脱粒器的調整方法，並按照要求進行調整。
作物的生長情況也會影響聯合收割機的脱粒效果。如果農作物生長不均勻，部分植株過早地成熟，而部分植株仍未成熟，就會導致脱粒不淨且碎籽增多。因此，農民在選擇收割時間時應儘量選擇整體成熟度較高的時期，以確保脱粒的效果。
此外，聯合收割機的維護保養也是影響脱粒效果的重要因素。如果收割機的刀片磨損嚴重，或者脱粒器的清潔不徹底，都會導致脱粒不淨且碎籽增多。因此，農民在收穫季節前應對聯合收割機進行全面的檢查和維護，確保機器的正常運轉和良好的脱粒效果。
氣候條件也會對聯合收割機的脱粒效果產生影響。如果在潮濕的天氣條件下進行收割作業，濕度會導致作物的脱粒困難，從而導致脱粒不淨且碎籽增多。因此，農民應該合理安排收割時間，選擇氣候條件較為乾燥的時期進行作業，以提高脱粒的效果。
