性質不同：敵敵畏屬於殺蟲殺蟎劑，具有觸殺、胃毒和燻蒸作用，百草枯屬於滅生性除草劑，具有觸殺和內吸作用。
防治對象不同：敵敵畏用來防治害蟲，比如咀嚼式和刺吸式口器害蟲，百草枯用來防治雜草，比如各種一年生雜草和多年生雜草。
適用對象不同：敵敵畏適用於蔬菜和農田作物，百草枯適用於果園、桑園、膠園、非耕地。
一、性質不同
1、敵敵畏
是一種廣譜性殺蟲、殺蟎劑，具有觸殺、胃毒和燻蒸作用。
2、百草枯
是一種快速滅生性除草劑，也是速效觸殺型滅生性聯吡啶類除草劑，具有觸殺作用和一定的內吸作用。
二、防治對象不同
1、敵敵畏
主要用來防治咀嚼式口器、刺吸式口器害蟲，具有高效、速效、持效期短、無殘留等特點。
2、百草枯
可防除各種一年生雜草，對多年生雜草有強烈的殺傷作用，但其地下莖和根能萌出新枝；對於已經木質化的棕色莖和樹幹無影響。
三、適用對象不同
1、敵敵畏
適用於蔬菜、果樹、煙草、水稻等多種農田作物。
2、百草枯
適用於防除果園、桑園、膠園及林帶的雜草，也可用於防除非耕地、田埂、路邊的雜草，對於玉米、甘蔗、大豆以及苗圃等寬行作物，可採取定向噴霧防除雜草。
四、藥物特點不同
1、敵敵畏
（1）代謝和降解：在室温下，敵敵畏的飽和水溶液以每天約3%的速度逐漸水解，並生成二甲基磷酸和二氯乙醛，在鹼性條件下的水解速度更快。
（2）殘留與蓄積：敵敵畏在自然環境中容易分解，當氣温為30℃時，經過18天左右便會水解50%。
（3）遷移轉化：敵敵畏的蒸氣壓較高，容易進入大氣，進行遷移轉化主要以大氣和水為介質。
（4）危險特性：遇到明火、高熱時會燃燒。受熱時會分解，並釋放出氧化磷、氯化物的毒性氣體。
2、百草枯
（1）在酸性環境下較穩定，在鹼性環境下會發生水解，同時在遇到紫外線的時候會分解。
（2）遇到土壤後，會迅速鈍化，從而失去藥效，因此百草枯對於清除土壤之中的草根和草種沒有太大的作用。
（3）不具備選擇性，無論是何種植物，綠色部分觸之即死。
