1、危害：夜光藻會毒害魚蝦的呼吸系統或抑制其呼吸，導致其窒息死亡；在分解的過程中，夜光藻會產生屍鹼和硫化氫使海水變質，危害水體生態環境；夜光藻還會滲透出高濃度的氨和磷。2、處理：夜光藻大量出現時，可在集中處潑灑漂白粉處理；養殖水體出現夜光藻危害，可換水處理，通過少量多次換水來改變水體環境；藉助高濃度的芽孢桿菌和超濃縮光合菌處理夜光藻，也可取得不錯的效果。
一、夜光藻的危害及處理
1、危害
夜光藻主要分泌神經毒素，毒害魚蝦的呼吸系統或抑制其呼吸，而且在形成赤潮的過程中，大量的夜光藻會粘附在魚鰓上，因而嚴重阻礙了魚蝦類的呼吸作用並導致魚蝦類窒息死亡。同時，夜光藻在分解過程中，會產生屍鹼和硫化氫，使海水變質，危害水體生態環境。此外，夜光藻還會滲透出高濃度的氨和磷。
2、處理
當大量出現夜光藻時，一般可以在集中處潑灑漂白粉處理。在養殖水體中出現夜光藻危害，還可以換水處理，通過少量多次換水來改變水體環境，從而抑制夜光藻的生長。此外，高濃度的芽孢桿菌和超濃縮光合菌，對夜光藻也有着良好的改善效果。
二、夜光藻發光的原因
1、夜光藻之所以發光，與它的細胞質中含有大量的熒光素有直接關係。夜光藻類能合成大量儲存於細胞內的發光底物熒光素，只有當細胞受到外界刺激時，在一系列信號分子的作用下，熒光素和氧氣在熒光素酶的催化下，才能迅速地發生反應，發光顆粒就會開始收縮而產生淡藍色的熒光。
2、夜光藻的這種生物發光現象又被稱為“藍眼淚”，在世界各地均有類似現象。它以罕見的密度出現在湖中，在富營養化的海區內分佈尤盛，可將整個湖泊變成了夜光湖，尤其是受到驚擾時，就會發出很亮的藍光，但不分泌毒素。
