本病由半知菌亞門真菌立枯絲核菌引起。以菌絲體或菌核在土中越冬，且可在土中腐生2~3年。菌絲能直接侵人寄主，通過水流、農具、糞肥傳播。病菌發育適温17℃~28℃，最高40℃~42℃，最低13℃〜15℃，適宜PH值為3~9.5。播種過密、間苗不及時、温度過高、通風不及時等均易發病。
甜瓜立枯病發病條件：土温11～30℃、土壤濕度20%～60%均有利於立枯絲核菌侵染。高温、連陰雨天多、光照不足、幼苗抗性差易染病。果實與土壤接觸，遇有澆水或降雨，即可引起發病。
病菌在土壤中越冬，翌年種植甜瓜後，果實與土壤接觸，遇有澆水或降雨，即可引起發病，尤其是久旱，突然遇雨易發病。
病菌以菌絲和菌核在土中或在發病組織上隨病殘體越冬。翌年以菌絲侵入寄主，形成初次侵染，隨病土、帶菌肥料和澆水傳播，引起再侵染。地温10～28℃均可侵染髮病，以16～20℃為最適。土壤過幹過濕，砂土地或幼苗徒長、温度不適等均有利於發病。長江流域幾乎全年都可發病。
